組織使命
醫療服務特色：
戰區醫療保健中心：
（1）奉核定為國軍第二作戰責任區醫療中心，醫療責任區涵蓋範圍北起花蓮，南至台東等國軍單位，主要任務負責區域內各單位醫療資源整合與官兵醫療
照顧。
（2）主持責任區內計十個醫療單位，每月召開「軍醫業務會報」，宣達政令與規定，隨時掌握各基層單位之醫療資源及需求，並協助解決問題。
- 軍陣醫學：執行軍陣精神醫學及體檢醫學。
- 軍患療養：對健保應出院但無法回部隊正常操課官兵患者，先留在醫院繼續療養。
- 執行軍事單位飲用水水質檢驗，維持國軍官兵飲用水衛生。
- 執行反毒宣導與軍人毒藥物篩檢隨時維持國軍官兵健康且免受污染。
- 為花蓮醫療網之一環醫院為花蓮地區緊急醫療網及精神醫療網責任醫院之一，提供各類急重症病患緊急醫療，與救護人員訓練，如初級救護技術員（EMT-I）初、複訓及心肺復甦術（CPR）等課程，同時協助周邊地區大量傷患醫療、護理人力支援並為後送醫院。
- 精神醫學：
（1）為花蓮最完備的精神醫療網責任醫院，擔任地區內軍人及民眾的精神醫療服務工作。
（2）負責軍中心輔官訓練，擔任花蓮縣各校教育訓練及心輔諮商老師，社區衛生所、學校的心理衛生教育。
（3）提供精神科患者日間照護服務及職能訓練作為精神科患者回歸社會橋樑。
（4）提供一般成人及軍人門診、急診、住院、身心門診、兒童青少年精神科、藥癮治療與社區精神醫療服務。 - 有快速機動與前進支援功能具有緊急支援及支援機場救援功能。
轉診、轉檢服務中心活絡本院周邊區域醫療網及醫療資源共享的原則，更進一步落實政府區域醫療網政策，達到醫療資源上、下游的整合。
有全功能藥品衛材之野戰支援體系可資運用。 - 轉診、轉檢服務中心活絡本院周邊區域醫療網及醫療資源共享的原則，更進一步落實政府區域醫療網政策，達到醫療資源上、下游的整合。
- 有全功能藥品衛材之野戰支援體系可資運用。
居家護理：
- 本院服務項目：
（1）定期訪視診察
（2）血壓與脈搏、呼吸之測量
（3）一般身體檢查及健康評估
（4）更換或拔除留置導管（鼻胃管、導尿管、氣切管）
（5）人工肛門造廔護理
（6）一般傷口護理
（7）血糖監測
（8）護理指導 - 地段管理範圍：花蓮市、花蓮縣吉安鄉、花蓮縣新城鄉、花蓮縣秀林鄉。
山地偏遠離島醫療服務：
- 本院於94年起每年1至2月支援合歡山雪季期間「醫療站診療服務」。
- 本院於100年2月至9月支援台東縣蘭嶼鄉衛生所牙科門診服務。
- 巡迴醫療：
負責東部海防班哨、安檢所及陸軍129旅共60個據點，由本院醫師每月巡迴1次。
社區健康照護：
- 定期健康講座及衛教：
針對校園、部隊及社區機關團體辦理健康巡迴講座與座談計每年度100場次以上。 - 社區義診及癌症篩檢：
(1) 多年來配合國民健康局多項健康促進政策，並深耕社區健康營造，辦理義診及癌症篩檢，如：99年6月至花蓮縣新城鄉鎮安宮、100年3月至本院花蓮市帝君廟門診部、101年5月至花蓮縣家樂福購物中心辦理義診。
(2)99-100年每周配合榮民服務處對散居榮民到宅做血壓、體溫監測、用藥諮詢及生理評估等。
(3)定期到花蓮縣新城鄉樹林腳社區活動據點做血壓監測、健康諮詢及護理指導等。 - 社區整合式篩檢及長者健檢：
- 配合花蓮縣新城鄉衛生所至各社區活動中心實施。
(1)社區醫療群：本院於93年12月1日成立，101年度執行中心為宏恩診所。
(2)參與基層診所：宏恩診所、高繼文眼科診所、中山身心診所、江耳鼻喉科診所、安台診所等5家診所。 - 援長照機構看診：
本院支援長照機構看診計私立慈暉老人養護中心、私立聲遠老人養護之家、私立博愛居安盧老人安養中心、私立全民養護中心、私立長榮養護院及私立崇恩長期照護中心等6個單位。 - 獨居老人義診：
本院每月定期至鄰近村落實施，每年度服務達100人次以上。 - 老人及國小校園流感疫苗注射：
本院每年10-11月配合至鄰近村落老人會活動實施流感疫苗注射，並配合花蓮縣新城鄉衛生所、吉安鄉衛生所、花蓮市衛生所至國小校園實施流感疫苗注射。